Grunnvannskvaliteten bestemmes i stor grad av geologien. Det finnes naturlige stoffer i grunnvann som kan gi bruksmessige problemer eller påvirke vannets smak, lukt og utseende. Forurensning kan skape problemer for drikkevannet.
Menneske, dyr og planter behøver en rekke mineraler. For høyt eller for lavt inntak kan være skadelig. Vann er vårt viktigste næringsmiddel og er i tillegg et utmerket løsemiddel. Grunnvann tar opp mineraler når det beveger gjennom undergrunnen. Grunnvann har vanligvis et langt høyere mineralinnhold enn overflatevann. I gamle dager førte ensidig kosthold til mangelsykdommer, og det var ikke uten grunn at mange la merke til at mineralrikt kildevann kunne ha legende virkning. Grunnvann er også bedre vernet mot bakterier enn vann i bekker og sjøer, og en pilegrim som led av kronisk diaré kunne holde seg frisk så lenge han fikk drikke kildevann.